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- 7XGBOV accessRights PUBLIC @default.
- 7XGBOV bibliographicCitation "Civic, Janko; Iñaki Tuñón; Harvey, Jeremy, 2024, "Replication Data for: Understanding Substrate Binding and Reactivity of Stearoyl-CoA Desaturase (SCD1) through Classical and Multiscale Molecular Dynamics Simulations", https://doi.org/10.48804/7XGBOV, KU Leuven RDR, V1" @default.
- 7XGBOV contributor 18a63b9fe3646010cfd9c4a27c432c587c28e41c @default.
- 7XGBOV contributor 9ad1e66a732cbbf624072983e7134ada1a7acf84 @default.
- 7XGBOV created "2025-08-25T10:40:16Z" @default.
- 7XGBOV creator 0000-0002-1728-1596 @default.
- 7XGBOV creator 0000-0002-6995-1838 @default.
- 7XGBOV creator 0009-0002-9207-835X @default.
- 7XGBOV description "Cet ensemble de données constitue le fondement de la publication qui lui est associée, fournissant tous les fichiers nécessaires pour répliquer et valider la recherche. Il comprend les fichiers de paramètres Amber (.parm7) et les fichiers de coordonnées (.rst7) nécessaires à l'exécution de simulations de dynamique moléculaire classique (MD) de la stéaroyl-CoA désaturase (SCD1) dans un complexe avec son substrat. En outre, il contient des fichiers de coordonnées (.xyz) et des fichiers de sortie Gaussian16 (.log) pour toutes les espèces de modèles de clusters pertinentes référencées dans l'étude. L'ensemble de données fournit également un fichier de trajectoire Amber (.crd), contenant les cadres initiaux de chaque fenêtre d'échantillonnage parapluie." @default.
- 7XGBOV description "Deze dataset vormt de basis van de bijbehorende publicatie en biedt alle benodigde bestanden om het onderzoek te repliceren en te valideren. Het omvat Amber parameterbestanden (.parm7) en coördinatenbestanden (.rst7) die nodig zijn voor het uitvoeren van klassieke moleculaire dynamica (MD) simulaties van stearoyl-CoA desaturase (SCD1) in complex met zijn substraat. Daarnaast bevat het coördinatenbestanden (.xyz) en Gaussian16 uitvoerbestanden (.log) voor alle relevante clustermodelsoorten waarnaar in de studie wordt verwezen. De dataset biedt ook een Amber-trajectbestand (.crd), met de initiële frames van elk paraplu-steekproefvenster." @default.
- 7XGBOV description "Dieser Datensatz bildet die Grundlage der damit verbundenen Publikation und stellt alle notwendigen Dateien zur Verfügung, um die Forschung zu replizieren und zu validieren. Es enthält Amber-Parameterdateien (.parm7) und Koordinatendateien (.rst7), die für die Durchführung klassischer molekulardynamischer (MD) Simulationen der Stearoyl-CoA-Desaturase (SCD1) in Komplex mit ihrem Substrat erforderlich sind. Darüber hinaus enthält es Koordinatendateien (.xyz) und Gaussian16-Ausgabedateien (.log) für alle relevanten Clustermodellarten, auf die in der Studie Bezug genommen wird. Der Datensatz enthält auch eine Amber Trajectory-Datei (.crd), die die ersten Frames aus jedem Regenschirm-Sampling-Fenster enthält." @default.
- 7XGBOV description "This dataset forms the foundation of the publication associated with it, providing all necessary files to replicate and validate the research. It includes Amber parameter files (.parm7) and coordinate files (.rst7) required for running classical molecular dynamics (MD) simulations of stearoyl-CoA desaturase (SCD1) in complex with its substrate. Additionally, it contains coordinate files (.xyz) and Gaussian16 output files (.log) for all relevant cluster model species referenced in the study. The dataset also provides an Amber trajectory file (.crd), containing the initial frames from each umbrella sampling window." @default.
- 7XGBOV identifier "doi:10.48804/7XGBOV" @default.
- 7XGBOV issued "2025-08-26T06:44:38Z" @default.
- 7XGBOV language ENG @default.
- 7XGBOV modified "2025-08-26T06:44:38Z" @default.
- 7XGBOV publisher 0419052173 @default.
- 7XGBOV subject "Chemical sciences" @default.
- 7XGBOV title "Données de réplication pour: Compréhension de la liaison au substrat et de la réactivité de la désaturase de Stearoyl-CoA (SCD1) grâce à des simulations de dynamique moléculaire classiques et multi-échelles" @default.
- 7XGBOV title "Replicatiegegevens voor: Substraatbinding en reactiviteit van stearoyl-CoA-desaturase (SCD1) door middel van klassieke en multiscale moleculaire dynamicasimulaties" @default.
- 7XGBOV title "Replication Data for: Understanding Substrate Binding and Reactivity of Stearoyl-CoA Desaturase (SCD1) through Classical and Multiscale Molecular Dynamics Simulations" @default.
- 7XGBOV title "Replikationsdaten für: Verständnis der Substratbindung und Reaktivität der Stearoyl-CoA-Desaturase (SCD1) durch klassische und multiskalige Molekulardynamiksimulationen" @default.
- 7XGBOV citedBy genid67294 @default.
- 7XGBOV type Dataset @default.
- 7XGBOV contactPoint genid67295 @default.
- 7XGBOV keyword "GFN2–xTB" @default.
- 7XGBOV keyword "QM/MM" @default.
- 7XGBOV keyword "SCD1" @default.
- 7XGBOV keyword "classical MD simulations" @default.
- 7XGBOV keyword "enzyme mechanisms" @default.
- 7XGBOV keyword "non–heme diiron enzymes" @default.
- 7XGBOV keyword "stearoyl–CoA desaturase" @default.
- 7XGBOV keyword "umbrella sampling" @default.
- 7XGBOV landingPage 7XGBOV @default.
- 7XGBOV theme TECH @default.
- 7XGBOV version "1" @default.