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- EBWSWB accessRights PUBLIC @default.
- EBWSWB bibliographicCitation "McFarlane, Neil Rory; Gui, Jiangli; Olah, Julianna; Harvey, Jeremy, 2024, "Replication Data for: Gaseous Inhibition of the Transsulfuration Pathway by Cystathionine β-Synthase", https://doi.org/10.48804/EBWSWB, KU Leuven RDR, V1" @default.
- EBWSWB created "2024-04-26T13:32:32Z" @default.
- EBWSWB creator 4ec28811fb1e1c0a8ca8490fd9f1d7ae6a0bfd01 @default.
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- EBWSWB creator 0000-0003-4608-3115 @default.
- EBWSWB description "A set of files for replication of the quantum chemical calculations and molecular dynamics simulations in a study on gas signalling by a heme protein. For the quantum chemical calculations, B3LYP/def2-TZVP//def2-SVP optimised geometries are included. For the molecular dynamics simulations, starting geometries in GROMACS-format are provided as well as the protonation states of all titratable amino acids and the complete forcefield parameters, including those for the pyridoxal 5'-phosphate cofactor, NO gas, and heme-bound cysteine." @default.
- EBWSWB description "Een reeks bestanden voor replicatie van de kwantumchemische berekeningen en moleculaire dynamieksimulaties in een onderzoek naar gassignalering door een heemeiwit. Voor de kwantumchemische berekeningen zijn geoptimaliseerde geometrieën van B3LYP/def2-TZVP//def2-SVP opgenomen. Voor de moleculaire dynamieksimulaties worden startgeometrieën in GROMACS-formaat verstrekt, evenals de protonatietoestanden van alle titreerbare aminozuren en de volledige krachtveldparameters, inclusief die voor de pyridoxale 5'-fosfaatcofactor, NO-gas en heemgebonden cysteïne." @default.
- EBWSWB description "Eine Reihe von Dateien für die Replikation der quantenchemischen Berechnungen und molekulardynamischen Simulationen in einer Studie über Gassignalisierung durch ein Hämprotein. Für die quantenchemischen Berechnungen werden B3LYP/def2-TZVP//def2-SVP optimierte Geometrien berücksichtigt. Für die molekulardynamischen Simulationen werden Ausgangsgeometrien im GROMACS-Format sowie die Protonationszustände aller titrierbaren Aminosäuren und die vollständigen Kraftfeldparameter, einschließlich derjenigen für den Pyridoxal-5'-Phosphat-Cofaktor, NO-Gas und Häm-gebundenes Cystein, bereitgestellt." @default.
- EBWSWB description "Un ensemble de fichiers pour la réplication des calculs chimiques quantiques et des simulations de dynamique moléculaire dans une étude sur la signalisation gazeuse par une protéine d'hème. Pour les calculs chimiques quantiques, les géométries optimisées B3LYP/def2-TZVP//def2-SVP sont incluses. Pour les simulations de dynamique moléculaire, des géométries de départ au format GROMACS sont fournies ainsi que les états de protonation de tous les acides aminés titrables et les paramètres complets du champ de force, y compris ceux du cofacteur pyridoxal 5'-phosphate, du gaz NO et de la cystéine liée à l'hème." @default.
- EBWSWB identifier "doi:10.48804/EBWSWB" @default.
- EBWSWB issued "2024-04-30T12:36:12Z" @default.
- EBWSWB modified "2024-04-30T12:36:12Z" @default.
- EBWSWB publisher 0419052173 @default.
- EBWSWB subject "Chemical sciences" @default.
- EBWSWB title "Données de réplication pour: Inhibition gazeuse de la voie de transsulfuration par la cystathionine β-synthase" @default.
- EBWSWB title "Replicatiegegevens voor: Gasvormige remming van de transzwavelweg door Cystathionine β-synthase" @default.
- EBWSWB title "Replication Data for: Gaseous Inhibition of the Transsulfuration Pathway by Cystathionine β-Synthase" @default.
- EBWSWB title "Replikationsdaten für: Gashemmung des Transsulfurationspfades durch Cystathionin-β-Synthase" @default.
- EBWSWB citedBy genid68345 @default.
- EBWSWB type Dataset @default.
- EBWSWB contactPoint genid68346 @default.
- EBWSWB keyword "Molecular Dynamics" @default.
- EBWSWB keyword "Quantum Mechanics" @default.
- EBWSWB landingPage EBWSWB @default.
- EBWSWB theme TECH @default.
- EBWSWB version "1" @default.